不同的防腐劑在不同的pH值下有不同的抗菌活性。對于含有有機酸防腐劑的配方，pH值的變化更容易引起抗菌活性的變化。以下是一含有有機酸類防腐劑的配方，不同pH值對配方防腐性能有明顯的影響，見表4。

      同一防腐體系a中含有有機酸防腐劑。對于該防腐體系只有pH值為5.65時能通過微生物挑戰性試驗，pH值高于這一值后均不能通過，從上述結果來看，pH的微小變化能明顯影響到防腐性能。有機酸只有在酸性條件下才有效，因為在酸性條件下，這些化合物才能以質子化的形式通過疏水性的磷脂雙分子的細胞膜。

相反，在較高的pH下，有機酸帶負電荷不能通過細胞膜。因此pH變化對有機酸的防腐性能表現最為突出。而防腐體系b，當pH值高于9.0時，防腐能力得到了明顯的加強。霉菌和酵母菌生長最適pH值都在5～6，而細菌的生長最適pH值在7左右。

但部分防腐劑在較高pH值時，防腐劑本身的穩定性降低。如卡松的抗菌活性pH值在4～8，其中的CMIT當pH值增加時容易失去活性。因此不同的防腐劑應選擇在合適的pH值范圍內使用，以達到良好的防腐性能。